一、合同備案基本程序：
經(jīng)貿(mào)部門審批 --> 向海關(guān)服務(wù)中心購買空白《登記手冊》--> 合同預(yù)錄入
---> 海關(guān)審核后開具《開設(shè)保證金臺帳聯(lián)系單》
---> 向中國銀行申請設(shè)立臺帳 ---> 海關(guān)核注銀行簽發(fā)的《臺帳登記通知單》
---> 海關(guān)進(jìn)行計算機異地傳輸 ---> 收到傳輸成功回執(zhí)后核發(fā)《登記手冊》。
二、合同備案所需單證：
1、經(jīng)營單位申請報告。
2、外經(jīng)貿(mào)主管部門《批準(zhǔn)證》，屬于進(jìn)料加工的需要加蓋稅務(wù)部門印章。
3、對外簽訂的進(jìn)出口合同。
4、經(jīng)營單位基本帳戶開立證明。
5、加工企業(yè)所在地經(jīng)貿(mào)部門出具的《加工生產(chǎn)能力證明》。
6、委托加工應(yīng)提供經(jīng)營單位與加工企業(yè)簽定的符合《中華人民共和國合同法》的委托加工合同（協(xié)議）。
7、開展異地加工貿(mào)易，須提供經(jīng)營單位所在地海關(guān)出具的關(guān)封，內(nèi)含《異地加工申請表》一式二份。
8、首次開展加工貿(mào)易須提供經(jīng)營單位和加工企業(yè)的《營業(yè)執(zhí)照》、《稅務(wù)登記證》復(fù)印件及《海關(guān)登記通知書》。
9、經(jīng)營單位的介紹信或委托書。
10、加工工藝說明。
11、如需異地口岸進(jìn)出口報關(guān)，須填寫《異地報關(guān)申請表》。
12、海關(guān)需要的其他資料。
注：1）海關(guān)對首次開展加工貿(mào)易的企業(yè)實行驗廠制度；對單證齊全、驗廠合格的企業(yè)，海關(guān)在3個工作日內(nèi)核發(fā)《登記手冊》。
2）辦理加工貿(mào)易合同備案的企業(yè)屬AA類的，免設(shè)臺帳；屬A類企業(yè)的，需設(shè)臺帳，實行“空轉(zhuǎn)”；屬B類企業(yè)的，需設(shè)臺帳，一般商品實行“空轉(zhuǎn)”，限制類商品實行“實轉(zhuǎn)”；屬C類企業(yè)的，需設(shè)臺帳，一律實行“實轉(zhuǎn)”；D類企業(yè)不得開展加工貿(mào)易業(yè)務(wù)。經(jīng)營單位與加工企業(yè)非同一分類的，海關(guān)按就低不就高的原則管理。對外商提供的進(jìn)口輔料品種在規(guī)定范圍內(nèi)，且金額在5000美金以下的，免辦手冊，不納入臺帳管理。
三、辦理5000美元以下78種客供輔料備案手續(xù)所需單證：
1、申請報告。
2、進(jìn)口發(fā)票、裝箱單（一式二份）。
3、出口合同（一式二份）。
4、經(jīng)營單位介紹信或委托書。
四、合同核銷
（一）基本流程：
合同執(zhí)行完畢后一個月內(nèi)企業(yè)向海關(guān)申請核銷 ---> 預(yù)錄入 ---> 海關(guān)審核
---> 簽發(fā)《臺帳核銷聯(lián)系單》 ---> 中國銀行銷帳 ---> 海關(guān)核銷結(jié)案 ---> 打印結(jié)案通知書。
注：企業(yè)必須在海關(guān)規(guī)定的期限內(nèi)向海關(guān)辦理核銷手續(xù)。對無正當(dāng)理由未向海關(guān)辦理核銷手續(xù)的，海關(guān)根據(jù)有關(guān)規(guī)定進(jìn)行處罰。
（二）所需單證
1、經(jīng)營單位申請核銷報告。
2、進(jìn)出口報關(guān)單。
3、《登記手冊》。
4、海關(guān)需要的其他單證，如核算表、劃料圖等反映實際加工情況的資料。
五、合同變更和展期
（一）基本流程：
經(jīng)貿(mào)部門審批 ---> 向海關(guān)服務(wù)中心變更預(yù)錄入 ---> 海關(guān)審核 ---> 簽發(fā)《臺帳變更聯(lián)系單》
---> 中國銀行臺帳回執(zhí) ---> 異地傳輸 ---> 傳輸成功后打印合同變更審批表。
（二）所需單證
1、填寫《合同變更申請表》或《合同延期申請表》，加蓋經(jīng)營單位公章。
2、變更、延期的合同。
3、外經(jīng)貿(mào)主管部門的批準(zhǔn)文件。
4、《登記手冊》。
5、申請報告及海關(guān)需要的其他單證。
備注：對貿(mào)易性質(zhì)不變、商品品種不變、合同變更金額小于1萬美元（含1萬美元）和按原審批合同延長加工期限不超過三個月的合同，直接到海關(guān)和中行辦理變更手續(xù)，不再經(jīng)外經(jīng)貿(mào)易部門重新審批。合同展期應(yīng)在《登記手冊》有效期內(nèi)向海關(guān)申請。
六、保稅倉庫貨物管理
（一）入庫貨物應(yīng)提供單證：
１、企業(yè)申請報告。
２、存入貨物的合同。
３、發(fā)票、裝箱單。
４、保稅倉庫貨物審批表。
（二）出庫貨物應(yīng)提供單證：
1、登記手冊。
2、企業(yè)申請報告。
3、進(jìn)口報關(guān)單。
4、保稅倉庫貨物提取審批表。
（三）辦理程序：
填寫《保稅倉庫貨物入（出）審批表》─→海關(guān)審批─→簽發(fā)《保稅倉庫貨物入（出）庫單》
─→貨主憑單辦理報關(guān)手續(xù)。
